(一)办公室。负责处理中共重庆市两江新区区委审计委员会办公室日常事务。负责机关日常运转,承担文电机要、督查考核、政务公开、新闻宣传、安全保密、信访、档案、机关后勤事务等工作;负责机关和所属单位党群工作;承担机关及所属单位的干部人事、机构编制、教育培训、退休人员管理、财务管理、国有资产管理等工作。
(二)法规审理科。负责组织起草规范性文件;组织开展法治宣传教育;承担机关规范性文件的合法性审查工作;承担机关行政应诉等工作,参与有关行政复议;审理有关审计业务事项,监督检查局机关的审计业务质量;负责对重大违纪违法问题线索的移送协调。
(三)审计整改督查科。负责全区审计项目中长期规划、年度审计项目计划的统筹和编制;负责审计规划和年度计划实施的督促检查;负责审计报表统计工作;负责审计整改督查相关工作,牵头起草年度审计整改工作情况报告;承担全区审计整改督查工作的指导和协调。
(四)内部审计指导监督科。负责推动有关单位建立健全内部审计制度;负责对内部审计机构和内审协会等进行业务指导,监督内部审计职责履行情况,检查内部审计业务质量;组织开展对社会审计机构出具的相关审计报告的核查。
(五)重大政策执行审计科。承担对市级、区级有关重大政策措施贯彻落实情况的审计。
(六)财政审计科。承担对区级预算执行、决算草案以及其他财政收支的审计;承担对区级各部门(含直属单位)预算执行情况和其他财政财务收支的审计;承担对镇人民政府(街道办事处)财政预算执行、决算草案以及其他财政收支的审计;承担对区级财政转移支付资金的审计;牵头起草区级预算执行情况及其他财政收支的审计结果报告、工作报告。
(七)企事业审计科。组织对使用区级财政资金的事业单位、人民团体和其他财政财务收支的审计;承担对区级部门管理的教科文卫专项资金的审计,承担对国际组织和外国政府援助、贷款项目的财务收支及其他项目的审计;承担对区政府部门管理的或其他单位受区政府委托管理的社会保障资金、社会捐赠资金和其他公共资金的筹集、管理、分配、使用情况以及有关经济活动的审计;承担对区属国有和国有资本占控股或主导地位的金融机构、企业的审计监督,承担相关企业领导人员经济责任审计。
(八)投资审计科。承担对区政府投资和以区政府投资为主的行政政法类、社会事业类、科技类、工业及产业结构调整类、市政设施类、交通投资类、水利能源类和资源环保类等公共投资建设项目预算执行、决算和建设运营情况的审计。
(九)经济责任审计科。负责区经济责任审计工作联席会办公室日常工作;承担对镇人民政府(街道办事处)党政主要领导干部的经济责任审计;承担对区级党政工作部门、事业单位、人民团体和按干部管理权限属于审计监督范围的有关单位主要负责人的经济责任审计;承担对区级部门管理的农业农村、水利以及其他相关公共资金和建设项目的审计;承担领导干部自然资源资产离任审计以及自然资源资产管理、污染防治和生态保护与修复情况审计。
(十)电子数据审计科。组织开展审计业务电子数据的采集、验收、整理和综合分析利用;承担对有关部门和国有企事业单位网络安全、信息化项目以及信息系统的审计;负责数字化审计的技术支持、软硬件管护、培训工作。